• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Анализ данных секвенирования

Читается

Пререквизиты: нет

Трудоемкость:  кредитов

60 аудиторных часов:

  • 30 часов лекции;
  • 30 часов семинары

Формы контроля:

  • 1 экзамен,
  • 3 домашних задания

О курсе

Данный курс направлен на знакомство с методами анализа данных секвенирования, полученных в результате технологий секвенирования следующего поколения, или NGS (от next-generation sequencing). В рамках курса студенты познакомятся с методами сборки генома из сырых данных DNA-seq. Познакомятся с методами картирования ридов и  поиском мутаций. Узнают о технологии RNA-seq и как производить анализ экспрессии генов. Проведение анализа перепредстваленности множеств генов в сигнальных, метаболических путях, статистические методы работе с базой MSigDB. Статистические методы для нахождения транскрипционных регуляторов используя генный сигнатуры, полученные на основе анализа дифференциальной экспрессии.

Программа

Ведущий лектор

Светличный Дмитрий Владимирович

Департамент больших данных и информационного поиска: Доцент