Курсы майнора для студентов набора 2018 года: Анализ данных секвенирования

Читается: 

Пререквизиты: нет

Трудоемкость:  кредитов

60 аудиторных часов:

• 30 часов лекции;
• 30 часов семинары

Формы контроля:

• 1 экзамен,
• 3 домашних задания

О курсе

Данный курс направлен на знакомство с методами анализа данных секвенирования, полученных в результате технологий секвенирования следующего поколения, или NGS (от next-generation sequencing). В рамках курса студенты познакомятся с методами сборки генома из сырых данных DNA-seq. Познакомятся с методами картирования ридов и  поиском мутаций. Узнают о технологии RNA-seq и как производить анализ экспрессии генов. Проведение анализа перепредстваленности множеств генов в сигнальных, метаболических путях, статистические методы работе с базой MSigDB. Статистические методы для нахождения транскрипционных регуляторов используя генный сигнатуры, полученные на основе анализа дифференциальной экспрессии.

Программа

Ведущий лектор