Информация для студентов 2022 года набора
Ограничения для выбора образовательным программам: нет
Максимальное число слушателей: 100
Целевая аудитория: студенты 2021 года набора
Дисциплины майнора:
2022-23
1 семестр - Биоинформатика ДНК, РНК и белков
В курсе изучаются основные закономерности молекулярной эволюции и математические методы анализа молекулярных последовательностей, включая алгоритмы поиска гомологичных последовательностей, выравнивания последовательностей и построения филогенетических деревьев, алгоритмы поиска ортологов и горизонтально перенесенных генов, предсказания генов и поиск мотивов, методы аннотации геномов de novo генами и функциональными элементами. Изучаются алгоритмы и методы предсказания вторичной структуры ДНК, РНК и белков. В течение курса студенты познакомятся с основными биоинформатическими ресурсами, включая базы данных, веб-порталы, компьютерные программы для работы с базами данных молекулярной биологии, а также программами, реализующими биоинформатические методы.
2 семестр - Медицинская биоинформатика
В курсе “Медицинская биоинформатика” изучается геномика человека, полиморфизмы и структурные варианты в популяции и их связь с заболеваниями. Дается представление о полногеномном поиске ассоциаций и консорциумных проектах, изучающих генетику рака и других заболеваний. Изучаются элементы системной биологии, показывающей как генетические изменения могут приводить к изменениям на функциональном уровне. Дается представление о метаболических и сигнальных сетях, онтологическом анализе. Изучаются ДНК-белковые взаимодействия и РНК-регуляция. Дается представление о сравнительном анализе геномов человека и ближайших видов, таких как шимпанзе или неандерталец.
2023-24
1 семестр - Анализ данных секвенирования
В данном курсе изучаются методы анализа данных технологий секвенирования следующего поколения, таких как DNA-seq, RNA-seq, Chip-Seq. Изучается методы сборки геномов de-novо из сырых ридов DNA-seq, анализ экспрессии генов на основе RNA-seq, методы обработки данных Chip-Seq. Дается представление о современных приложениях и практиках использования.
2 семестр - Введение в эпигеномику
Цель курса - дать практические навыки применения методов биоинформатики для анализа и интерпретации биологических данных по эпигеномике.